Rosetta@home
From Wikipedia, the free encyclopedia
Rosetta@home és un projecte de computació distribuïda per a la predicció de l'estructura de les proteïnes que utilitza la plataforma Berkeley Open Infrastructure for Network Computing (BOINC). És dirigit pel Laboratori Baker, de la Universitat de Washington. El seu objectiu és predir acoblaments proteïna-proteïna i dissenyar noves proteïnes mitjançant l'ús d'uns 55.000 ordinadors actius cedits per voluntaris, amb un rendiment mitjà de gairebé 19.036 gigaFLOPS a 5 de febrer del 2023.[3] Foldit, un videojoc basat en Rosetta@Home, intenta assolir el mateix objectiu per mitjà del proveïment participatiu. Tot i que el projecte se centra principalment en la investigació bàsica per millorar la precisió i robustesa dels mètodes proteòmics, Rosetta@home també duu a terme investigacions aplicades en l'àmbit de la malària, la malaltia d'Alzheimer i altres patologies.[4]
| |
Tipus | predicció de l'estructura de les proteïnes, computació voluntària, projecte BOINC i programari lliure |
---|---|
Versió inicial | 6 octubre 2005 |
Versió estable | Rosetta Beta: 5.98 Rosetta Mini: 3.17 |
Llicència | Lliure per a l'ús acadèmic i sense ànim de lucre,[1] llicència comercial disponible[2] |
Epònim | Pedra de Rosetta |
Característiques tècniques | |
Sistema operatiu | multiplataforma |
Plataforma | BOINC |
Equip | |
Desenvolupador(s) | Laboratori Baker (Universitat de Washington) i Rosetta Commons |
Més informació | |
Lloc web | boinc.bakerlab.org… (anglès) |
| |
Igual que la resta de projectes BOINC, Rosetta@home utilitza la capacitat de processament d'ordinadors en repòs cedits per voluntaris per executar càlculs sobre unitats de treball. Els resultats són enviats al servidor central del projecte, on se'ls valida i assimila a les bases de dades del projecte. Es tracta d'un projecte multiplataforma que es pot fer servir en una gran varietat de configuracions de maquinari. Els usuaris poden seguir el progrés de la seva pròpia predicció de l'estructura de les proteïnes gràcies a l'estalvi de pantalla de Rosetta@home.
A més d'investigar sobre malalties, la xarxa Rosetta@home serveix per provar nous mètodes de bioinformàtica estructural. Una vegada han estat desenvolupats i considerats estables després de funcionar a la gran varietat d'ordinadors voluntaris de Rosetta@home, aquests nous mètodes són utilitzats en altres aplicacions basades en Rosetta, com ara RosettaDock i el Human Proteome Folding Project. Dues de les proves més importants pels nous mètodes desenvolupats gràcies a Rosetta@home són els experiments Critical Assessment of Techniques for Protein Structure Prediction (CASP) i Critical Assessment of Prediction of Interactions (CAPRI), experiments que avaluen els mètodes més avançats de predicció de l'estructura de les proteïnes i predicció d'acoblaments proteïna-proteïna, respectivament. Rosetta@home sovint és un dels predictors més reeixits en aquests experiments. El projecte és un dels millors predictors d'estructura terciària que existeixen.[5]