DCC
From Wikipedia, the free encyclopedia
Deletirani protein kolorektumskog karcinoma, znan i kao DCC, je protein koji je kod ljudi kodiran genom DCC. Odavno je uplitan u rak debelog crijeva.[5]
Odkad je prvi put otkriven u studiji kolorektumskog karcinoma 1990,[6] bio je u fokusu značajnog broja istraživanja. DCC je godinama imao kontroverzno mjesto kao gen supresije tumora i dobro je poznat kao receptor provodljivost aksona, koji reagira na netrin-1.[7]
U novije vrijeme DCC je okarakteriziran kao receptor ovisnosti, a iznesene su mnoge hipoteze koje su oživile interes za kandidaturu DCC kao gena za supresiju tumora, jer to može biti ovisno o ligandu koji se često epigenetički utišava.[8]
Gen DCC nalazi se na lokusu 18q21.3 i ima ukupno 57 mogućih egzona i 43 moguća introna. Ovo teorijski rezultira sa 13 pravilno prerađenih, navodno dobrih proteina. Dužina polipeptidnog lanca je 1.447 aminokiselina, a molekulska težina — 158.457.[9][10] Tipskii DCC protein ima jedan signalni motiv peptida i jedanaest domena, uključujući višestruke domene slične imunoglobulinu, transmembranski domen i nekoliko domena fibronektina tipa 3.[11]
DCC ima vanćelijska mjesta vezanja i za netrin-1 i za heparin. Smatra se da je heparin-sulfat takođe prisutan tokom nevrnog rasta, kao tip kofaktora za aksonsko provođenje.[12][13] Pokazano je da DCC unutarćelijski ima mjesto proteolize kaspaze-3 na Asp 1290.
DCC i neogenin, dva od netrin-1 receptora, nedavno su pokazali da imaju mjesta za fosforilaciju tirozina (na Y1420 na DCC) i vjerovatno stupaju u interakciju sa porodicom Src kinaze u regulaciji odgovora na netrin-1.[14]
- Aminokiselinska sekvenca
- Simboli
C: Cistein
D: Asparaginska kiselina
E: Glutaminska kiselina
F: Fenilalanin
G: Glicin
H: Histidin
I: Izoleucin
K: Lizin
L: Leucin
M: Metionin
N: Asparagin
P: Prolin
Q: Glutamin
R: Arginin
S: Serin
T: Treonin
V: Valin
W: Triptofan
Y: Tirozin
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MENSLRCVWV | PKLAFVLFGA | SLFSAHLQVT | GFQIKAFTAL | RFLSEPSDAV | ||||
TMRGGNVLLD | CSAESDRGVP | VIKWKKDGIH | LALGMDERKQ | QLSNGSLLIQ | ||||
NILHSRHHKP | DEGLYQCEAS | LGDSGSIISR | TAKVAVAGPL | RFLSQTESVT | ||||
AFMGDTVLLK | CEVIGEPMPT | IHWQKNQQDL | TPIPGDSRVV | VLPSGALQIS | ||||
RLQPGDIGIY | RCSARNPASS | RTGNEAEVRI | LSDPGLHRQL | YFLQRPSNVV | ||||
AIEGKDAVLE | CCVSGYPPPS | FTWLRGEEVI | QLRSKKYSLL | GGSNLLISNV | ||||
TDDDSGMYTC | VVTYKNENIS | ASAELTVLVP | PWFLNHPSNL | YAYESMDIEF | ||||
ECTVSGKPVP | TVNWMKNGDV | VIPSDYFQIV | GGSNLRILGV | VKSDEGFYQC | ||||
VAENEAGNAQ | TSAQLIVPKP | AIPSSSVLPS | APRDVVPVLV | SSRFVRLSWR | ||||
PPAEAKGNIQ | TFTVFFSREG | DNRERALNTT | QPGSLQLTVG | NLKPEAMYTF | ||||
RVVAYNEWGP | GESSQPIKVA | TQPELQVPGP | VENLQAVSTS | PTSILITWEP | ||||
PAYANGPVQG | YRLFCTEVST | GKEQNIEVDG | LSYKLEGLKK | FTEYSLRFLA | ||||
YNRYGPGVST | DDITVVTLSD | VPSAPPQNVS | LEVVNSRSIK | VSWLPPPSGT | ||||
QNGFITGYKI | RHRKTTRRGE | METLEPNNLW | YLFTGLEKGS | QYSFQVSAMT | ||||
VNGTGPPSNW | YTAETPENDL | DESQVPDQPS | SLHVRPQTNC | IIMSWTPPLN | ||||
PNIVVRGYII | GYGVGSPYAE | TVRVDSKQRY | YSIERLESSS | HYVISLKAFN | ||||
NAGEGVPLYE | SATTRSITDP | TDPVDYYPLL | DDFPTSVPDL | STPMLPPVGV | ||||
QAVALTHDAV | RVSWADNSVP | KNQKTSEVRL | YTVRWRTSFS | ASAKYKSEDT | ||||
TSLSYTATGL | KPNTMYEFSV | MVTKNRRSST | WSMTAHATTY | EAAPTSAPKD | ||||
LTVITREGKP | RAVIVSWQPP | LEANGKITAY | ILFYTLDKNI | PIDDWIMETI | ||||
SGDRLTHQIM | DLNLDTMYYF | RIQARNSKGV | GPLSDPILFR | TLKVEHPDKM | ||||
ANDQGRHGDG | GYWPVDTNLI | DRSTLNEPPI | GQMHPPHGSV | TPQKNSNLLV | ||||
IIVVTVGVIT | VLVVVIVAVI | CTRRSSAQQR | KKRATHSAGK | RKGSQKDLRP | ||||
PDLWIHHEEM | EMKNIEKPSG | TDPAGRDSPI | QSCQDLTPVS | HSQSETQLGS | ||||
KSTSHSGQDT | EEAGSSMSTL | ERSLAARRAP | RAKLMIPMDA | QSNNPAVVSA | ||||
IPVPTLESAQ | YPGILPSPTC | GYPHPQFTLR | PVPFPTLSVD | RGFGAGRSQS | ||||
VSEGPTTQQP | PMLPPSQPEH | SSSEEAPSRT | IPTACVRPTH | PLRSFANPLL | ||||
PPPMSAIEPK | VPYTPLLSQP | GPTLPKTHVK | TASLGLAGKA | RSPLLPVSVP | ||||
TAPEVSEESH | KPTEDSANVY | EQDDLSEQMA | SLEGLMKQLN | AITGSAF |